Памятуя о принципах работы ордена тамплиеров и их отходе от общей церковной доктрины, Ватикан принимает решение о создании отдельного органа, который контролировал бы «настроения умов» в средневековой Европе. Так появляется святая инквизиция, в ведении которой находились расследования и наказания инакомыслящих. Под этой категорией, само собой, подразумевались иноверцы, колдуны, ведьмы и прочие обладатели сверхъестественных способностей. 
 
В состав инквизиции входили несколько монашеских орденов, чьи методы дознания оказались наиболее эффективными. Создание этого карающего органа надолго погрузило Европу в ужас и мрак террора. Сложно сказать, сколько же на самом деле «ведьм» и «оборотней» было поймано и казнено за несколько веков существования инквизиции.Святые отцы получили полное право выносить вердикт предполагаемому чернокнижнику и приводить его в исполнение. Естественно, большая часть пострадавших - это самые обычные деревенские знахарки и жертвы злых языков. Те, кто обладал более объемными познаниями, не вписывающимися в церковные рамки, создавали тайные общества, добраться до которых инквизиторам так и не удалось. Словно в отместку Ватикану, по всей Европе распространились масонские ложи, сатанизм и прочая ересь, с которой следовало бороться святой инквизиции. 
 
Особенно сильно от очищения «огнем и мечом» пострадали Италия и Франция. В отличие от Германии и Англии, эти два государства более ревностно придерживались католических догматов и отдавали все силы на борьбу за чистоту души своего народа. Причем рвение это оказалось настолько сильно, что привело к уничтожению целых деревень. Впрочем, массовые казни ведьм были не редки и в других странах. Плети инквизиции распространились и на Новый Свет, так что даже там не оказалось спасения от отцов-дознавателей.